硬脑膜下脓肿常见的并发症为脑 血栓性静脉炎 与静脉窦炎，有时可穿破蛛网膜而引起 化脓性脑膜炎 或 脑脓肿 。后遗症包括 癫痫 、失语、 偏瘫 及 脑积水 等。
前列腺脓肿可向直肠破溃，形成直肠周围 脓肿 。
细菌性肝脓肿出现并发症常使病情加重，且混淆临床征象，导致误诊。 常见并发症为 脓肿 破裂，向邻近脏器穿破。穿入胸腔产生 脓胸 及胸膜支气管瘘，或穿入腹腔、心包腔；有时还可穿入胃、十二指肠、结肠、肾、胰腺；少数病例可穿入腔静脉、肝静脉、胸导管或腹壁等，亦可发生栓塞、 血栓形成 以及其他部位形成脓肿。引起肝内血管破裂由胆道排出即 胆道出血 者少见。
脓肿 破溃引起盆腔及其周围组织感染。
肺脓肿 急性阶段如未能及时有效的治疗，如支气管引流不畅，抗感染治疗效果不佳，不充分、不彻底，迁延3个月以上即为慢性肺 脓肿 。
1.胸腔感染 膈下感染 可引起反应性 胸腔积液 ，或经淋巴途径蔓延到胸腔引起胸膜炎;亦可穿入胸腔引起 脓胸 。 2. 消化道出血 和消化道瘘 因 脓肿 可腐蚀消化道管壁而引起消化道 反复出血 、 肠瘘 或胃瘘。 3. 贫血 。
阿米巴肝脓肿的主要并发症为继发 细菌感染 及 脓肿 向周围组织突破。继发细菌感染时 寒战 、 高热 较明显， 毒血症 加重，血白细胞总数及中性粒细胞均显著增多。脓液呈黄绿色，或有臭味，镜检有大量脓细胞，但细菌培养阳性率不高。阿米巴 肝脓肿 蝗向周围器官穿破，如穿过膈肌形成 脓胸 或 肺脓肿 ，穿破至支气管造成胸膜-肺-支气管瘘，穿破至心包或腹腔引起 心包炎 ...
由大肠埃希杆菌或厌氧菌等引起的肛管直肠周围脓肿易并发 肛瘘 。
咽旁脓肿 是咽喉两侧的颈淋巴结化脓性感染性疾病。 脓肿 常继发于咽炎或扁桃体炎，但咽喉部可能并无明显炎症。可发生于任何年龄。颈部可能有明显肿胀。治疗应静脉给予青霉素。
硬脑膜外脓肿也可并发其他各种 颅内感染 ，但由于硬脑膜对化脓性炎症的扩散有阻挡作用，所以多数炎症只局限在硬脑膜外间隙。如果 脓肿 较大，有肉芽组织形成并压迫脑组织时也可后遗 癫痫 及其他局限性 神经症 状。
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