并发肝肾、功能损害以及 呕血 、 大咯血 。
晚期可并发关节功能障碍、关节畸形和强直。以及因骨肥大变形所致的局部隆起。
并发 休克 、心衰、肾衰和 肝功能衰竭 。
局部并发症有窦道或瘘管、直肠周围感染、 肠梗阻 、 肠穿孔 、 腹腔脓肿 等；全身性并发症有关节炎、 结节性红斑 、脉管炎等。
（１） 急性并发症 ① 低血糖昏迷。 ② 高血糖昏迷（酮症酸中毒，非酮症高渗昏迷） ③ 乳酸酸中毒 （２） 慢性并发症 ① 肾脏：蛋白尿、感染、肾功能衰竭 ② 心脏：冠状动脉栓塞、心绞痛、心衰、心律不整 ③ 大脑：脑充血、脑栓塞 半身不遂 ④ 眼睛：白内障、青光眼、视网膜病变 视力下降、失明 ⑤ 足：麻木、缺血、无力、溃病、截足
并发骨髓瘤， 骨纤维肉瘤 ， 软骨肉瘤 等疾病。
糖原贮积病Ⅱ型三型均可并发呼吸道感染，也是常见的死亡原因之一。
并发症较罕见，但可感染心脏、脑和脑膜，以及引起神经、睾丸、胆囊、肝脏和骨的炎症。慢性病例通常导致长期健康不良，但本病罕有致死者。
随病情发展，或病变程度不同，出现的症状体征可以是疾病本身表现，也可以看作并发症(参见临床表现)。另外，应注意继发的 肺部感染 、 尿路感染 、 褥疮 等。
主要是并发 胆结石 ，个别病例可有慢性肝内 胆汁 游积而发生 肝硬化 。
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