并发症常见 继发感染 ，伴 胸腔积液 。
并发症较罕见，但可感染心脏、脑和脑膜，以及引起神经、睾丸、胆囊、肝脏和骨的炎症。慢性病例通常导致长期健康不良，但本病罕有致死者。
随病情发展，或病变程度不同，出现的症状体征可以是疾病本身表现，也可以看作并发症(参见临床表现)。另外，应注意继发的 肺部感染 、 尿路感染 、 褥疮 等。
本病常见的并发症是导致关节畸形。
常见的并发症： 1.肝细胞功能紊乱， 肝硬化 ，皮肤铜色色素沉着， 糖尿病 (并发率占50%~60%); 2.以 心脏肥大 、 心力衰竭 、 心律失常 、传导阻滞为临床表现的 心肌病 ; 3.垂体功能衰竭常见并可导致 睾丸萎缩 和性欲丧失; 4. 腹痛 ; 5.关节炎; 6.软骨钙质沉着。
本病长见的并发症： 1.反复发生感染 如 肺炎 ， 脓胸 ， 肺脓肿 ，肠炎和结肠炎，可至 肛瘘 。常见于肝脏、脾脏、肺及骨骼发生 脓肿 ，发生脑的曲霉脓肿。食管，小肠和输尿管可发生阻塞。 2.鼻炎； 3. 胃窦狭窄 ； 3. 慢性腹泻 ； 4.病儿发育延迟。常致身材矮小，并发 红斑狼疮 ， 幼年型类风湿性关节炎 等。
并发阑尾炎。
随病情发展，出现的症状体征多样，可以是本病表现，也可以看作并发症。 1. 骨折 或脱位 肿瘤侵及骨骼系统时，可引起骨折、脱位、脊柱畸形，可并发 脊柱侧凸 ， 先天性胫骨假关节 和 先天性锁骨假关节 。肿瘤压迫腓总神经时可致足下垂。 2. 癫痫 肿瘤侵及中枢系统时，可有癫痫样发作，应注意防止外伤。 3. 神经纤维瘤 有时可自行破溃出血，也可发生肿瘤内部的大出血...
本病可并发 腹泻 、结膜炎或复发性 口腔溃疡 。儿童多肌腱末端病或血清阴性肌腱末端病和关节病综合征，可能是幼年脊柱关节病的早期。
1. 慢性肉芽肿病 可并发 肝脾肿大 、深部 脓肿 和 肺炎 。其他还有鼻炎、结膜炎、 皮炎 、 肝脓肿 等。 2.Chédiak-Higashi综合征，可并发白化病(黑色素细胞)、神经系统疾病(神经细胞)和出血(血小板)。
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