可并发肾功能衰竭、 高血压脑病 等并发症。
肾异位血管的主要并发症包括 尿路梗阻 、感染及结石。
在大约1/3的病例中，肾脏及其收集系统发育异常，大约一半的病例中肾实质变薄，收集系统扩张，提示有 输尿管梗阻 存在。
可出现药物难以控制的 高血压 、严重 视网膜病变 ; 脑血栓 、 心力衰竭 、 心肌梗死 、肾功能衰竭等并发症。
最常见并发症是肾实质坏死，其次栓塞常常影响其他腹部器官（如胰腺，胃肠道）。
本病是严重型致命性心 血管畸形 之一, 预后极差。如不及时治疗, 约有75 %的病人在一岁内死亡, 延误了手术时间病情将很快发展成 肺动脉高压 , 肺血管梗塞而失去手术机会。且常合并其它畸形，使得本病的治疗更加困难，合并的其它畸形有 动脉导管未闭 、左上腔静脉、完全性肺静脉异位连接、 房间隔缺损 、 单心室 、 单心房 及主动脉弓中断等。
预后 腘动脉瘤最大危险是来自血栓或栓塞的缺血引起的截肢。据报道截肢率可达16%～44%，Lilly报道了对48例腘 动脉瘤 血运重建术后，术前无症状患者5年通畅率为91%，有症状的5年通畅率为54%，Dawson等对比了71例手术治疗和非手术治疗的腘动脉瘤患者，平均随访5年，57%的无症状腘动脉瘤患者发生了血栓栓塞性并发症，而手术治疗患者随访10年，肢体救活...
...颈交感神经节引起Horners综合征；压迫喉返神经引起 声音嘶哑 ；压迫上腔静脉引起 上腔静脉综合征 ；累及肾动脉引起 血尿 、 尿闭 及 肾缺血 后血压升高。并且可影响全身重要器官的供血，如心脏、大脑、内脏器官等，也是导致死亡的重要原因。65%～75%病人在急性期（2周内）死于心脏压塞、 心律失常 等心脏合并症。 对本病进行不同的手术治疗，其并发症也不相同...
可并发 高血压 、体位性 低血压 、 低蛋白血症 、 多尿 、 肾性糖尿 、 代谢性酸中毒 、 低钾血症 、感染等，晚期发生 尿毒症 。可发生各系统的损害，并发心功能衰竭，继发血管栓塞性并发症，并发出血及血栓等等。
重叠器官特异性自身免疫病如甲状腺炎和甲状腺功能亢进症。可单侧或双侧发病。出现缺血性 视神经炎 所引起的突然失明，为本病最严重的并发症。
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