该病主要与 铜绿 假单胞菌 肺炎 鉴别，主要依靠痰培养结果。有时为两种细菌合并感染。 铜绿 假单胞菌肺炎合并 菌血症 罕见。
真菌性肺炎（mycotic pneumonia）是指由真菌及放线菌引起的 肺部感染 。它占所有内脏 真菌感染 的首位，虽然比较少见，但常在许多全身性疾患基础上发生，可使诊断及治疗发生困难，故在临床工作中有一定重要意义。近10～20年来由于广泛应用广谱抗生素、细胞毒药物及肾上腺皮质激素，其发病率及临床重要性正不断增加，并日益受到重视。
诊断 凡易感或具危险因素者患社区获得性 肺炎 以及气管插管机械通气患者发生早发性呼吸机相关肺炎都应警惕流感嗜血杆菌肺炎。 鉴别 鉴别诊断主要应与其他病原体肺炎相鉴别，有赖于正确采集标本和选择培养基。
支原体肺炎 （mycoplasmal pneumonia）旧称原发性非典型肺炎、冷凝集阳性肺炎，是由支原体（mycoplasma,MP）感染引起的、基本病程间质性肺炎及毛细支气管炎样改变，临床表现为顽固性剧烈 咳嗽 的肺部炎症。MP是儿童时期肺炎和其它呼吸道感染的重要病原之一。
诊断 出现 肺部感染 症状体征或在真菌流行地区出现肺部感染，经抗细菌治疗无效者，应考虑该病的可能，诊断主要依据病原学检查。其中痰、尿、粪便、分泌物、 胸腔积液 、血液、脑积液、脓液等的涂片、培养、组织检查找到真菌孢子及（或）菌丝是诊断的重要依据，结合临床资料可作出诊断。另外真菌抗原皮肤试验、血清学检查、动物接种等可协助诊断。组织学检查见到典型的菌丝及真菌培养...
诊断 变形杆菌肺炎多见于中、老年男性，多有原发病症，确诊有赖于细菌学检查。 鉴别 变形杆菌 肺炎 的临床及胸部X线改变与多数肠道细菌肺炎的表现类似（如肺炎杆菌、大肠杆菌等），鉴别诊断主要依靠痰或其他支气管分泌液中病原菌的检查。
支气管肺炎 是小儿的一种主要常见病，尤多见于婴幼儿，也是婴儿时期主要死亡原因。支气管肺炎又称小叶肺炎，肺炎多发生于冬春寒冷季节及气候骤变时，但夏季并不例外。甚至有些华南地区反而在夏天发病较多。患病后免疫力不持久，容易再受感染。支气管肺炎由细菌或病毒引起。
本病需与 细菌性肺炎 、 病毒性肺炎 、真菌性 肺炎 ，ARDS及淋巴细胞性间质性肺炎（LIP）相鉴别。其中尤以LIP与本病均易发生于AIDS患儿更难鉴别，但LIP多呈慢性，以咳及干罗音为主，有全身淋巴结增大及唾腺增大，可在肺活检标本中查出EBV-DNA 1 ，而PCP不能查出。
肺炎衣原体感染(chlamydia pneumonia infection)是由 肺炎 衣原体引起的感染性疾病，主要引起成人及青少年的 非典 型肺炎，亦可引起支气管炎、咽炎及扁桃体炎等急性呼吸道感染，据统计在引起肺炎的病因中，是继肺炎球菌、流感嗜血杆菌之后引起社区获得性肺炎的第三位主要病原体。美国报告每年发病约30万例，而 鹦鹉热 衣原体引起的肺炎仅约150...
恙虫病 是由立克次体引起的全身性传染病，常侵犯肺部引起肺炎等病变。
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